Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF1CQ15572 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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