Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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