Protein–RNA interactions for Protein: Q14749

GNMT, Glycine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNMTQ14749 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNMTQ14749 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNMTQ14749 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms