Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL9A3Q14050 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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