Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNGB1Q14028 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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