Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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