Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1CQ13936 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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