Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNTB1Q13884 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SNTB1Q13884 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SNTB1Q13884 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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SNTB1Q13884 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNTB1Q13884 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms