Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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