Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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