Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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