Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNW1Q13573 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNW1Q13573 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNW1Q13573 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms