Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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