Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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