Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SEMA3FQ13275 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SEMA3FQ13275 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SEMA3FQ13275 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3FQ13275 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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