Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTP4A2Q12974 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTP4A2Q12974 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTP4A2Q12974 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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