Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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TRAF2Q12933 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TRAF2Q12933 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF2Q12933 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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