Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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