Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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