Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STX4Q12846 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
STX4Q12846 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
STX4Q12846 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
STX4Q12846 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
STX4Q12846 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STX4Q12846 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STX4Q12846 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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STX4Q12846 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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