Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCB1Q12824 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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