Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNA1Q09470 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNA1Q09470 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms