Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms