Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP1-1Q07627 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP1-1Q07627 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms