Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms