Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX8Q06710 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms