Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEUP1Q05D60 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms