Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms