Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms