Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB1P82279 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB1P82279 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB1P82279 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB1P82279 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB1P82279 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms