Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL7P80098 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL7P80098 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL7P80098 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL7P80098 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL7P80098 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL7P80098 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL7P80098 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL7P80098 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL7P80098 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL7P80098 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178 ms