Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX6P78412 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX6P78412 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX6P78412 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX6P78412 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms