Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERVK_113P62684 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms