Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms