Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB2AP61019 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB2AP61019 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB2AP61019 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB2AP61019 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms