Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms