Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRP55822 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms