Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP5P51878 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP5P51878 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP5P51878 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP5P51878 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms