Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RAB5CP51148 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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