Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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