Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NESP48681 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NESP48681 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NESP48681 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NESP48681 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NESP48681 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NESP48681 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms