Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UTRNP46939 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UTRNP46939 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UTRNP46939 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UTRNP46939 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UTRNP46939 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UTRNP46939 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms