Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRXP46100 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms