Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms