Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCAMP43121 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCAMP43121 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCAMP43121 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCAMP43121 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCAMP43121 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCAMP43121 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms