Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX11P35716 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SOX11P35716 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX11P35716 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms