Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms