Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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HOXD13P35453 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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HOXD13P35453 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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