Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC1P35052 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPC1P35052 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms