Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB4P30926 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms